GridION/ナノポアシーケンサー共同研究・受託解析

超ロングリードの配列取得を可能にしたナノポアシーケンサーGridIONとPromethIONを導入しています。
GridION 当センターでは、高品質なゲノムDNAが得られている場合、１００Kを超えるロングリードが得られております。
ロングリードの経験が豊富な当センターにお気軽にご相談ください。

ナノポア社の認証も取得し、サービスプロバイダーのひとつとして受託解析も実施しています。

・メタ１６S全長シーケンス、真菌叢解析

・ゲノムの決定（バクテリアの場合は、コンプリート可能です）細菌、真菌、真菌、植物、動物ゲノム等。

・ゲノムの構造変異

・リピート領域の解析

などに応用が可能です。

イルミナのシーケンサーと比較すると、塩基の精度が低いのが現状ですが、ロングリードならではの解析が可能です。
また品質の高いイルミナのデータと組み合わせることで、より長くて精度の高い配列取得が可能です。

データ解析もお気軽にご相談ください。ご自身や他社で取得したシーケンスデータの解析も実施可能です。

ナノポアのシーケンスはサンプルによってはデータ量やリード長が期待ほど得られないことがあります。

また塩基精度は以前より大きく改善してはいますが、まだ他のシーケンサーと比較すると低いということもあり
ご希望の解析が可能か簡単には判断できません。

どんなサンプルでもシーケンスを行うことは可能ですが、必ずしもご納得いただける結果が得られるとは限りません。
対応可能かどうかよくお話をお聞きしますので、まずはお気軽にご相談ください。

※他の受託会社様にもデータ提供が可能です。お気軽にご相談ください。

実験医学ナノポアナノポアテクノロジーは日々のアップデートがめまぐるしいのが特徴です。

そのため、受託解析としての実施はまだまだ難しい面もあります。

ライブラリー調整、配列取得、インフォマティクスなど共同研究という形で様々な研究のお手伝いをしたいと考えています。

お気軽にご相談ください。

実験医学2018年1月号を参考にしてください。