DNBSEQーT7/G400次世代シークエンスの受託
DNBSEQ(旧称MGIseq)はMGI社が開発した新しい次世代シーケンサーです。
低コストで大容量のシーケンスが可能です。
安心の国内でのシーケンスですので、安い海外受託サービスに対して、短い納期で対応できます。
特徴
※GC比が65~70%を超える細菌の場合、Q30が低くなる傾向になります。解析には問題ありません。
DNBseq次世代シークエンスの受託解析
DNAあるいはRNAを受け入れて、ライブラリー調整とシーケンスを実施し、Fastqを納品いたします。
必要に応じてデータ解析も実施可能です。1G~100G程度(それ以上も可)に対応します。
他のバイオ系受託会社さん・バイオベンチャーさんにもシーケンスデータを提供します。 お気軽にご相談ください。
解析内容
受け入れサンプル
植物、昆虫、真菌、細菌等のゲノムDNA
RNA
ショットガンメタゲノムサンプル
・DNA
PCR-Freeの場合:Qubitで測定し30ng/ulの濃度で60ul以上。
著しい断片化(スメア)がないこと。PCRを併用する場合は、上記条件に満たなくても可
・RNA こちらをご覧下さい。
※DNAやRNAの抽出も実施できます。
納品物
作業報告書
生のシーケンスデータ(Fastqファイル)USBメモリ・DVD-R・HDD等で納品します。
作業内容
1.DNAの品質確認・定量を行います。
2.PCRを併用・あるいはPCR-Freeの方法でライブラリー調整を行います。
3.DNBSEQで次世代シークエンスを行います。(150bpx2で1~100Gb)
4.Fastqファイルをお返しします。※データ解析が必要な場合はご相談ください。
受託費用と納期
価格はお問い合わせください。データ量による(1G~100G程度)
多検体の場合は割引があります。お気軽にお問い合わせください。
通常納期・PCRを用いたライブラリー調整の場合
細菌0.5Gb 1.5万円 (サンプル数・納期による)・・・バクテリアゲノム比較解析に最適
1Gbp 2万円 ・・・放線菌などゲノムサイズが大きい細菌
5Gb 3万円 ・・・真菌やショットガンメタゲノム解析に最適
10Gb 4万円
50Gp 6万円
90Gb 10万円HDD等のメディア代・サンプル送料全て込みです。追加の費用は一切発生しません。
通常納期は2-3ヶ月程度です。1か月くらいで納品することが多いのですが、再シーケンスや混雑時・試薬の納品が停滞した場合にはお待たせする可能性があり、余裕を見て長めに設定しています。
お急ぎの場合・納期の指定がある場合は、別途見積もりとなります。ご相談ください。
取得するデータ量の目安は???
・リファ
レンスにマッピングして変異の解析を行いたいとき(リシーケンス)・・・ゲノムサイズの30かけが目安です。
例えば、ゲノムサイズが1Gbの生物であれば、30倍の30Gbのシーケンスが必要になります。・新規にゲノムを決めたいとき(de novo)・・・ゲノムサイズの100かけが目安です。
例えば、ゲノムサイズが1Gbの生物であれば、100倍の100Gbのシーケンスが必要になります。ご予算や解析環境(コンピューター)にもよります。お気軽にご相談下さい。
注意事項
詳細はお問い合わせください。最善の方法をご提案いたします。
DNBSEQがはじめて不安の方はお気軽にご相談ください。試しにシーケンスすることもできます。